为提高国家能源决策民主化、科学化水平，2014年2月10日，国家能源局印发《国家能源局关于确定第一批研究咨询基地的通知》（国能规划[2014]63号文），确定"水电水利规划设计总院、国务院发展研究中心、中国工程院"等16家单位为第一批研究咨询基地。
《通知》明确研究咨询基地的主要任务是：根据国家能源局的部署，开展能源战略、规划、政策、法规、体制改革等方面的研究，提出研究报告和建议。《通知》提出国家能源局还将制订相关管理办法，建立动态管理机制，激励相关研究机构提高咨询质量。国家能源局需委托外部机构承担研究和咨询任务的，原则上从研究咨询基地名单中选取。
多年来，水电总院受国家发展改革委、国家能源局、国务院三峡建委、水利部、环境保护部、住房和城乡建设部、国家安全监管总局、审计署、电监会、国家档案局等国家有关部门委托，承担着行业规划、技术管理、工程验收和政策研究等工作，其以水电、风电、太阳能光伏发电等专业配备齐全的高级技术人才队伍为支撑，忠实履行可再生能源行业技术管理职责，认真完成政府委托的各项任务，在水电、风电、太阳能光伏发电建设领域发挥着不可替代的作用。
水电总院协助国家能源局制定、修改和完善《光伏电站开发管理办法》等管理办法，积极推动国家对风电大基地开发建设决策，相继完成哈密基地送出研究，推进哈密800万千瓦风电和125万千瓦光伏建设的实施，推进承德二期、酒泉等基地，山西风电规划、陕西通渭330kV统筹送出基地规划和建设工作；配合国家能源局推进分布式光伏应用示范区建设，编制海洋能示范项目实施方案与重点研讨内容；完成全国31省（区）水电、风电、太阳能发电以及生物质能发电等可再生能源地图绘制工作；编制了《中国风电"弃风"研究报告》、《2012年中国太阳能发电建设统计评价报告》、《2012年中国生物质发电建设统计评价报告》等行业报告；完成国家能源局、财政部委托的2012年度全国3000多个可再生能源项目，共340亿元补贴资金的清算等工作；受国家能源局委托，组建国家可再生能源信息管理中心，建立了国内全国最权威的可再生能源行业平台和资源数据库，成为我国可再生能源信息化建设的领头羊；开展了光热发电选址与示范项目研究工作，承担投产水电、风电、光电项目的造价统计分析工作；开展了抽水蓄能电站电价形成机制研究、沿海地区海水抽水蓄能资源开发潜力评价研究等。
2013年，水电总院围绕"强安全、美环境和福民生"的主题，不断改进水电工程项目审查方式，严格预可研和可研审查内容，简化审查程序，加强工程项目审查前与各设计单位的事先沟通与交流，提高审查工作质量；重视水库移民和环保问题，改进水电环保设计预审查制度，加强环保科研工作；高度重视水电工程安全与工程投资问题，及时发现、研究和解决工程规划、设计、施工各阶段出现的各种技术问题，确保了水电工程安全第一、工程经济、技术可靠。
2013年，水电总院共承担和完成水电、风电、太阳能发电前期技术审查以及蓄水验收、枢纽工程专项验收、安全设施验收和其他技术管理工作任务共计563项。其中，完成全国新一轮22个省的抽水蓄能规划审查工作，经国家能源能源局批复2020年推荐站点59个，合计装机容量7485万千瓦，备选站点14个，合计装机容量1660万千瓦。截至2013年末，全国发电装机总量达12.47亿千瓦，同比增长9.3%。其中，水电装机2.8亿千瓦，同比增长12.3%；火电8.6亿千瓦，同比增长5.7%，核电1461万千瓦，同比增长16.2%；并网风电7548万千瓦，同比增长24.5%；并网太阳能发电装机容量1479万千瓦，增长3.4倍。新能源和可再生能源发电装机占比31%，较上年提高5.76个百分点。中国水电、风电装机容量均居世界第一。
2013年，水电总院进一步加强行业技术标准建设和科技研发，推动科技成果迅速向现实生产力转化。水电总院承担国家能源局科研项目26项、中国电建科研项目3项、水电总院立项34项，包括《提高我国水电开发利用效率研究》、《高拱坝库盘变形及对大坝工作性态影响研究》、《生物质能制气与发电综合利用关键技术及经济性研究》以及《可再生能源勘察标准体系研究》等；水电总院承担着国家、行业在编标准共149项，2013年新立GB标准1项、新立NB标准29项，发布NB标准18项、正在报批21项，完成送审稿33项；与水电顾问组织翻译的《中国电力行业标准（英文版）》出版，首批30项标准涉及水电工程规划、勘测、设计和施工等，是迄今为止中国水电行业首套规模最大、覆盖最广的英文标准，这对提升中国水电科技的国际影响力、增强中国企业在水电国际市场的竞争力具有重要作用。
水电总院将以此次入选国家能源局研究咨询基地为契机，进一步发挥其在可再生能源领域的技术优势和行业管理优势，争创可再生能源领域技术和服务一流水平，建设"专业化发展，信息化支撑，标准化提升，合法化开拓，国际化腾飞"的可再生能源领域的智库和国际一流的研究院，促进中国可再生能源行业的健康发展。(水电总院 张妍)
